Nonostante ricorrenti crisi dovute a più fattori che inevitabilmente si ripercossero sulla conduzione del Circolo la Gondola non ha mai cessato in questi anni di esercitare la sua funzione istituzionale cioè la diffusione della fotografia in tutte le sue forme. 

Sistemata la veste istituzionale assumendo dal 1 gennaio 2003 la figura giuridica di associazione di promozione sociale il Circolo ha operato con impegno ed entusiasmo in diverse direzioni; di particolare importanza è stata la creazione dell’Archivio Fotografico. 

Partendo da poche centinaia di immagini, eredità storica del Circolo, una decina d’anni fa si è avviato il recupero dei fondi fotografici di ex soci e di terzi in molti casi destinati alla dispersione o peggio alla distruzione. 

Oggi, grazie a un’azione capillare e insistita, L’Archivio Storico della Gondola vanta oltre tredicimila stampe “vintage” comprendenti i più bei nomi della fotografia italiana dal dopoguerra ai giorni nostri: oltre agli ex Soci,  duemila stampe di Paolo Monti, l’intero fondo di Sergio Del Pero, di Giorgio Giacobbi, di Stefano Boscolo, di Ennio Puntin Gognan, di Carlo Trois, di Laura Martinelli Stroili, nonché numerose stampe di Gianni Berengo Gardin, Fulvio Roiter, Bepi Bruno, Elio Ciol, Carlo Bevilacqua.

Sono presenti anche opere di Mario Giacomelli, Giorgio Lotti, Piergiorgio Branzi, Alfredo Camisa, Luigi Ghirri, Mario Cattaneo, Ernesto Fantozzi, Francesco Cito, Pino Guidolotti, Nino Migliori, Giuseppe Pino, Mario Lasalandra e moltissimi altri.

L’Archivio, sistemato presso il Museo Fortuny, è quasi completamente informatizzato e in larga parte visibile sul sito della Gondola; oltre alla parte iconografica esso comprende una piccola ma preziosa biblioteca e una ricca documentazione sociale. 

Per qualità fotografica e compattezza storica è ritenuto fra i maggiori del nostro Paese ed è frequentato da studiosi, appassionati e soprattutto studenti per le loro ricerche di laurea. 

Anche l’attività espositiva ha subito un consistente rilancio; sono più di trenta le mostre prodotte negli ultimi dieci anni, quasi sempre tematiche, formate sia da inediti dei Soci  che da immagini dell’Archivio Storico.  In alcune occasioni sono stati presi in considerazione aspetti della problematica realtà veneziana: l’Arsenale, le trasformazioni territoriali, il rapporto della città con l’acqua, suo elemento/cardine, la memoria del passato,  mentre sul versante della ricerca la Gondola conferma la sua attenzione per l’evoluzione del pensiero fotografico proponendo come nella recente “0/24 – quotidiane_connessioni” le caratteristiche di incertezza e di ambiguità della fotografia contemporanea che escludono ogni presupposto di “bellezza” e di virtuosistica intenzione.